به گزارش خبرگزاری کتاب ایران (ایبنا) از این 100 مجموعه 9 مجموعه از راه خرید و بقیه به صورت اهدا بوده است. بخشی از این مجموعه‌ها که مشروط به نگهداری جداگانه نبوده است، پس از ضرب مهر اهدایی، در کتابخانه مرکزی مورد استفاده قرار می‌گیرد و بخشی دیگر، بنابر شرایط واگذاری اهداءکنندگان، در محلِ جداگانه و به نام ایشان، محفوظ است.

کتاب‌ها و مجله‌های چاپی این مجموعه‌ها، فهرست شده یا در دست فهرست نویسی است. مخازن این نوع مجموعه ها به صورت بسته اداره می‌شود و اکنون پژوهشگران مرکز و مراجعان خارج از مرکز از آن استفاده می‌کنند.

 یادداشت‌ها و مدارک و اسناد چاپ نشده کتابخانه های اختصاصی، سرنوشت دیگری دارد؛ برابر آیین‌نامه کتابخانه، این نوع یادداشت‌ها و اسناد چاپ نشده، آن اندازه که پس از بررسی و ارزش یابی، برای چاپ و انتشار مناسب تشخیص داده می‌شود، در یک جلد یا مجلداتی از سوی کتابخانه مرکز انتشار می‌یابد، تا جامعه فرهنگی از آن بهره‌مند شود، اما کتابخانه موظف است، برخی دیگر از اسناد و مدارک را که جنبه خانوادگی و خصوصی دارند، در جای مناسب نگاه دارد و استفاده از آن را صرفاً برای خانواده اهداء کنندگان مجاز بداند.

کتابخانه مرکز دائرة المعارف بزرگ اسلامی، نخست خود را نسبت به حفظ وصیانت این میراث فرهنگی و سپس بهره مندی محققان از آن میراث متعهد می‌داند.