ايبنا – وهذه الرسالة تناقش السير والسلوك والتكامل الاخلاقي وكشف العلوم الحقيقية والعوائق التي تعيق الوصال في طريق السالك والتي لا تتوجه الى عامة الناس بل ان ملاصدرا يتوجه الى متلقين خاصين وهم العلماء ذو النظرة السطحية ممن لديهم معرفة ضئيلة بظواهر العلوم والشرع ويعتبرون انفسهم من الكمّلين (العلماء والفضلاء والحكماء والمعمرين) ويشكلون حجر عثرة امام ارباب الحقيقة.

ويعتبر ملاصدرا، اشباه العلماء والسطحيين بانهم اخطر من العوام واكثر عداء للمعرفة حيث يقول "ان لم تعرف هذا (اي حب الدنيا) فانه سيكون بمثابة غرور وجهل لان معظم العوام وجهال العالم سيكونون افضل واشرف منك، لان هؤلاء يقرون بهذا المرض اي حب الدنيا لكنك لا تقر به".

والعلم الحقيقي الذي يبحث عنه ملا صدرا ويعتبر اكتسابه غاية الكمال الانساني، هو ليس العلم الصوري والظاهري. ويقول في كتابه "ان العلم الذي مقصوده الاصلي، كمال الحقيقة ويؤدي الى التقرب الى الله سبحانه وتعالى هو العلم الالهي وعلم المكاشفات لا علم المعاملات وجميع ابواب العلم ... وان ارباب العمل وباقي العلوم الجزئية معزولون عن هذا الباب من العلم وهو علم الحقيقة". 

ويرى ان العلم الحقيقي الذي يتأتي عن طريق المكاشفة والشهود يتحقق فقط من خلال "السيادة الحقيقية والدراية المعنوية" للنبي الاكرم (ص) وان الحواجز والعوائق التي تعيق معظم الناس من ادراك وكسب هذا العلم، نابعة من ثلاثة مبادئ تم تسمية هذه الرسالة على اساسها وهي "المبادئ الثلاثة". وحسب ملاصدرا فان المبادئ الثلاثة هي:
المبدأ الاول: الجهل بمعرفة النفس التي هي حقيقة الانسان.
المبدأ الثاني: حب الجاه والمال والرغبة في الشهوات والملذات وسائر المتع.
المبدأ الثالث: تسويلات النفس الامارة وتدليسات الشيطان المكار واللعين الذي يظهر السئ جيدا والجيد سيئا.

وقسم ملا صدرا "رسالة المبادئ الثلاثة" الى 14 فصلا. لكن هذا الكتاب وزعها على 14 بابا. الابواب الثلاثة الاولى هي تبيان للمبادئ الثلاثة المذكورة والابواب الثلاثة الثانية – الاقدم فالاقدم – هي تبيان لنتائج الابواب الثلاثة الاولى. وفي البابين السابع والثامن ميز الخطأ عن الصواب ووضح طريقة السير على الصراط المستقيم وطريق الحقيقة. والباب التاسع متعلق بالعلم الحقيقي وامتيازه عن العلوم الظاهرية. والبابان الحادي عشر والثاني عشر حول نور الايمان ولزوم تصفية الباطن وتزكية النفس لتجلي هذا النور.

ووضح ملاصدرا في الباب الثاني عشر، نتيجة اكتساب هذه المعرفة. والباب الثالث عشر ينطوي على موضوعات حول الامراض النفسية لاسيما الغرور والكبرياء التي تصيب اشباه العلماء وتمنعهم من نيل العلم الحقيقي. والباب الرابع عشر يتطرق الى العمل الصالح والعلم النافع اي العلاقة بين العلم والعمل.

واسلوب ملاصدرا في هذه الرسالة سلس وجلي، رغم انه استخدم مثل باقي كتاب النثر في العصر الصفوي، المفردات العربية غير المألوفة والتي كانت سائدة اكثر مما كانت عليه في القرنين السادس والسابع او في الوقت الحاضر. وبما ان كلام ملاصدرا كتب بصدق وخلوص نية، فإنه مؤثر وممتع. وفضلا عن ذلك فانه جاء بكلام لطيف بالفارسية العربية واشارات ملفتة الى النقاط العلمية ليثري القيمة العلمية لرسالته.

وفي نهاية الكتاب، هناك فهرس عن الايات القرانية والاحاديث والاشعار الفارسية والعربية والاعلام والمجموعات والكتب والاماكن والمصطلحات والتعابير. 

وصدرت الطبعة الثانية لكتاب "رسالة المبادئ الثلاثة" في 256 صفحة ويباع ب 80 الف ريال ايراني.